En contrario a la mayoría de las creencias, los continentales africanas religiosas, criollos, árabes, malayos, Antolotes y Shirazis, conforman la población de Anjouan. La religión mayoritaria es el Islam sunita, aunque la isla está llena de un gran número de mezquitas, la práctica religiosa no es tan estricta como lo es en muchos otros países de la observación de Islam. El alcohol está prohibido para los musulmanes. Sin embargo, en su mayor parte, la religión hasta el momento no ha sido un riesgo político, no hay historia registrada de cualquier extremismo de cualquier naturaleza, ni ha habido ninguna división asociada a la religión.